Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms