Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms