Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms