Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms