Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms