Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMF1P82094 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMF1P82094 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms