Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms