Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms