Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms