Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR1H2P55055 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR1H2P55055 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR1H2P55055 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR1H2P55055 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR1H2P55055 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR1H2P55055 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms