Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms