Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms