Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms