Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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