Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms