Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms