Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms