Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT2P45379 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms