Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PI4KAP42356 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms