Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms