Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms