Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms