Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7BP35670 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms