Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms