Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPS1P31327 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms