Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms