Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LMO1P25800 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LMO1P25800 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LMO1P25800 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LMO1P25800 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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