Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRGP23470 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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