Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR4P22455 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms