Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms