Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CXCL3P19876 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CXCL3P19876 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CXCL3P19876 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CXCL3P19876 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL3P19876 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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CXCL3P19876 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CXCL3P19876 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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