Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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