Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms