Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms