Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms