Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI2P10070 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms