Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTXN2P0C2S0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTXN2P0C2S0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms