Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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