Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYC1P08574 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYC1P08574 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYC1P08574 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYC1P08574 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms