Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPRP00739 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPRP00739 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPRP00739 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPRP00739 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPRP00739 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPRP00739 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPRP00739 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPRP00739 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPRP00739 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPRP00739 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HPRP00739 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPRP00739 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPRP00739 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPRP00739 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPRP00739 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPRP00739 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms