Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIC3O95833 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms