Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms