Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms