Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms