Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms