Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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