Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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