Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms