Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM227AF5H4B4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM227AF5H4B4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM227AF5H4B4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms