Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms